Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms