Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms