Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms