Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vps29Q9QZ88 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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