Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms