Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf11Q9QYK7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf11Q9QYK7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms