Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms