Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms