Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms