Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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