Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lsm4Q9QXA5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lsm4Q9QXA5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms