Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms