Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoaQ9QUI0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms