Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc2lQ9JME7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms