Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms