Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tnfrsf19Q9JLL3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms