Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tgm1Q9JLF6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgm1Q9JLF6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tgm1Q9JLF6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tgm1Q9JLF6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgm1Q9JLF6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tgm1Q9JLF6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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