Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nectin3Q9JLB9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nectin3Q9JLB9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nectin3Q9JLB9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nectin3Q9JLB9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nectin3Q9JLB9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nectin3Q9JLB9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms