Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Upk3aQ9JKX8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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