Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms