Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scamp4Q9JKV5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms