Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms