Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms