Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra4Q9JJT2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms