Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfrsf13bQ9ET35 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms