Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rb1cc1Q9ESK9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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