Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Aff4Q9ESC8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aff4Q9ESC8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms