Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hipk3Q9ERH7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hipk3Q9ERH7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms