Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn2Q9ER65 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms