Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms