Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms