Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tspan4Q9DCK3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan4Q9DCK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms