Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms