Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf4Q9DAW6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms