Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift43Q9DA69 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms