Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms