Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp12Q9D9M2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp12Q9D9M2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms