Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg7Q9D906 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms