Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms