Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms