Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Derl3Q9D8K3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Derl3Q9D8K3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms