Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Alkbh4Q9D8F1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Alkbh4Q9D8F1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Alkbh4Q9D8F1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Alkbh4Q9D8F1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Alkbh4Q9D8F1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Alkbh4Q9D8F1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Alkbh4Q9D8F1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Alkbh4Q9D8F1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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