Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necab3Q9D6J4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms