Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins2Q9D600 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms