Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc130Q9D516 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms