Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms