Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms