Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy3Q9D394 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms