Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrnp35Q9D384 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrnp35Q9D384 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms