Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt20Q9D312 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt20Q9D312 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms